A criação do PPGBBS data de 2012, tendo surgido com a função de cumprir parte da missão do IAM no âmbito de formar recursos humanos com atenção às necessidades regionais e nacionais, produzindo conhecimento científico e atuando em inovação tecnológica na saúde. Após aprovação pela CAPES, houve homologação pelo Conselho Nacional de Educação/CNE, já com as modalidades de Mestrado e Doutorado Acadêmico. O programa foi originalmente aprovado com o conceito 4, mas desde 2013 ascendeu para o conceito 5.
