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Conta com doze salas, onde são executadas atividades de manutenção das diferentes colônias, estudos comportamentais, estudos populacionais, de interação vetor-parasito, de susceptibilidade de populações naturais de culicídeos e de verificação de atividade de produtos larvicidas.
O laboratório do Departamento de Entomologia do Instituto Aggeu Magalhães está equipado para desenvolver estudos biológicos, morfológicos, bioquímicos, genéticos e moleculares voltados para culícideos vetores, com ênfase para os gêneros Culex e Aedes. O espaço físico é formado por uma área comum dotada de bancadas de trabalho bancadas de equipamentos, armários de material de consumo, além de salas individuais destinadas a freezers e refrigeradores, extração de ácidos nucleicos, preparação de reações de PCR, eletroforese e foto documentação, além de espaço para os procedimentos em capelas de exaustão e fluxo laminar.
